Yuma Tsukumo ist unser neuer Held und ein junger, mutiger Duellant, dessen Eltern auf mysteriöse Weise verschwanden. Als sein Mitschüler Shark Yumas einziges Andenken an sie zerstört und ihn zu einem Duell um sein Deck herausfordert, stehen seine Karten schlecht. Genau in diesem Moment erscheint der luminiszierende Geist Astral, der ihm zu gewinnen hilft. Astral ist auf der Suche nach seinen Erinnerungen, die zu Monstern wurden und in Form von 99 "Nummer-Karten" überall auf der Welt verstreut sind. Yuma beschliesst, ihm bei der Suche zu helfen und stürzt dadurch in ein spannendes Abenteuer voller Gefahren, Duelle und Monster! Es warten neue Spieler, neue, faszinierende Monster und spannende Duelle in der nächsten Inkarnation von Yu-Gi-Oh!