Am Weihnachtsabend 2029 wird Japan von einem apokalyptischen Virus heimgesucht der das Land in Chaos und Anarchie stürzt. Die internationale Organisation GHQ übernimmt in einer Art Kriegsrecht die Kontrolle über Japan und befriedet das Land wieder , was nicht allen Bürgern gefällt.Zehn Jahre später begegnen sich zufällig Shu Ouma, ein 17-jähriger High-School Student und Inori Yuzuriha, die Lead-Sängerin der bekannten Band "Egoist". Shu, ein grosser Fan von Inori, findet heraus dass sie Mitglied der Widerstandsgruppe "Undertaker" ist, einer Wiederstandsgruppe die für die Befreiung Japans kämpft. Der eher zurückhaltende Shu gerät mitten in den Strudel der Kämpfe und nachdem er durch den Kontakt mit einem besonderen Genome die Fähigkeit erlangt hat aus den Herzen seiner Mitmenschen Waffen zu materialisieren, versucht er Inori und damit auch den "Undertakern" zu helfen.