"Ich bin ein roter Schmetterling, der auf der Suche nach einer neuen Unterkunft umherirrt." Mit solch geheimnisvollen Botschaften verabreden sich Yusaku und Yukiko - Eltern des genialen Schülerdetektivs Shin'ichi Kudô - zu ihren Treffen. Abseits dieser kleinen Rätsel gibt es jedoch noch mehr zu entdecken: Da wäre zum Beispiel die Geschichte eines 15-jährigen Genies, das eine Zeitmaschine entwickelt, um seiner 17-jährigen Freundin endlich in ihrem Alter zu begegnen. Oder die Story rund um den naiven Keisuke, der aus Versehen ein System aktiviert, das schon bald die ganze Erde zu zerstören droht. Dazu gesellen sich ein Detektiv im Miniformat, ein verjüngter Schwertkampfmeister sowie Detektiv Conans kleine Freunde Genta, Mitsuhiko und Ai in einem mysteriösen Making-of!