Im 21. Jahrhundert ist der Einsatz von Arbeitsrobotern in Japans Metropolen unabdingbar geworden. Selbst die Polizei setzt bei ihren Einsätzen auf modernste Waffentechnik, u.a. Kampfroboter und mechanische Hund a e. Das Verbrechen allerdings schläft nie. Ein Syndikat, das es sich zum Ziel gesetzt hat die Herrschaft über die Menschheit an sich zu reissen, überfällt die Stadt aus dem Nichts heraus und zeigt den Bewohnern sowie den herbeigerufenen Einsatzkräften, dass sie nicht die geringste Chance gegen ihre hoch entwickelten Kampfroboter haben. Um den Verbrechern, die hinter dem Syndikat stehen, habhaft zu werden und die Städte vor weiteren Angriffen zu schützen, ruft Japans Regierung das Geheimprojekt Metal Jack ins Leben. Diese Spezialeinheit soll in Zukunft verhindern, dass die Verbrecher mit ihren übermächtigen Robotern ganze Städte in Schutt und Asche legen. Eine harte, aber nicht unlösbare Aufgabe für die drei Geheimpolizisten: Ryo Aguri, Go Goda und Ken Kanzaki. Jedoch sind sie sich nicht bewusst, dass der Feind längst unter ihnen ist ...