Im Mittelpunkt von Mr. Robot befindet sich Elliot, ein junger Mann, der tagsüber in einer Firma als Angestellter für die Internetsicherheit arbeitet. Sobald jedoch die Nacht hereinbricht, verwandelt sich Elliot in seiner Eigenschaft als Hacker in ein kriminelles Genie. Im Dark Web trifft er auf eine geheimnisvolle Untergrundorganisation, die von einem sogenannten Mr. Robot angeführt wird. Die Gruppe rekrutiert Elliot und verlangt von ihm, sich in das Sicherheitssystem der Firma zu hacken, die er eigentlich im Rahmen seiner Arbeit beschützen soll. Nun muss sich Elliot entscheiden, auf welcher Seite er steht.