Die Geschichte von Watchmen spielt über 3 Jahrzehnte nach den Ereignissen der Comics, in denen der Superheld Ozymandias New York zu grossen Teilen zerstörte und Millionen Menschen durch eine vermeintliche Alien-Invasion tötete, um die Welt vor einem Atomkrieg zu bewahren. Viele der maskierten Helden der Vergangenheit sind mittlerweile tot oder haben sich in den Untergrund zurückgezogen. Dr. Manhattan, ein gottgleiches, soll sich zum Beispiel auf dem Mars verstecken.